儿童保健部下设儿童群体保健科、新生儿疾病筛查科、儿童生长发育科、高危儿管理科、儿童营养科、儿童心理卫生科、儿童眼保健科、儿童口腔保健科、儿童耳鼻喉保健科、儿童康复科、儿科、新生儿科、儿童中医科等科室。共有专业技术人员114人，其中高级职称13人，中级职称35人。

拥有现代化诊疗仪器设备，如丹麦耳声发射仪、骨密度分析仪、丹麦听性脑干反应筛查仪、上海综合素质测评系统和智商测定软件、儿童YX-1021发育及膳食营养分析评估系统、眼底血管造影仪、新生儿眼底照相仪、儿童视力筛查仪、综合验光仪、无痛洁牙机、树脂光固化充填仪、耳鼻咽喉内窥镜系统、耳鼻咽喉专业的诊疗台、耳鼻咽喉多功能治疗仪、国产先进的压缩式雾化机、多功能吊塔、多功能监护仪、床边DR、常频与高频呼吸机、CPAP、无创双水平呼吸机、新生儿脑功能监护仪、空氧混合仪、新生儿眼底筛查仪、T组合、新生儿多功能暖箱、新生儿转运暖箱、车载呼吸机、微量注射泵、微量输液泵、微量血糖仪、微量血气分析仪、除颤仪等。